HMMER은 시퀀스 분석을 위한 소프트웨어 패키지이다. homologous protein이나 nucleotide sequence를 확인하기 위해서 사용되고, sequence alignment를 수행한다. 시퀀스의 profile-HMM을 비교해서 homology를 탐지한다. null model 과 비교해서 더 좋은 score를 내는 시퀀스가 profie-HMM을 구성한 시퀀스와 homologous하다는 것을 의미한다. profile-HMM은 multiple sequence alignment로 만들어진다.(HMMER 패키지 내의 hmmbuild program 사용) HMMER는 pFam과 InterPRo와 같은 protein family database의 core utility이다. Profile HMM p..